Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sem1P60897 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sem1P60897 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sem1P60897 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sem1P60897 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sem1P60897 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sem1P60897 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sem1P60897 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sem1P60897 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sem1P60897 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms