Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pdrg1P59048 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pdrg1P59048 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pdrg1P59048 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pdrg1P59048 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pdrg1P59048 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pdrg1P59048 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pdrg1P59048 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pdrg1P59048 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pdrg1P59048 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pdrg1P59048 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pdrg1P59048 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Pdrg1P59048 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pdrg1P59048 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pdrg1P59048 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pdrg1P59048 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pdrg1P59048 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pdrg1P59048 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pdrg1P59048 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pdrg1P59048 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms