Protein–RNA interactions for Protein: P58391

Kcnn3, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn3P58391 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnn3P58391 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnn3P58391 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnn3P58391 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnn3P58391 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnn3P58391 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnn3P58391 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnn3P58391 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnn3P58391 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnn3P58391 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnn3P58391 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnn3P58391 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnn3P58391 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnn3P58391 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnn3P58391 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnn3P58391 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnn3P58391 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnn3P58391 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnn3P58391 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnn3P58391 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnn3P58391 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnn3P58391 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnn3P58391 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnn3P58391 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnn3P58391 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnn3P58391 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnn3P58391 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnn3P58391 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnn3P58391 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnn3P58391 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnn3P58391 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnn3P58391 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnn3P58391 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnn3P58391 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnn3P58391 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnn3P58391 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnn3P58391 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnn3P58391 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnn3P58391 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnn3P58391 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnn3P58391 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnn3P58391 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnn3P58391 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms