Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RabggtbP53612 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RabggtbP53612 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
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