Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CntfP51642 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntfP51642 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntfP51642 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntfP51642 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntfP51642 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntfP51642 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntfP51642 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntfP51642 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntfP51642 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntfP51642 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntfP51642 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CntfP51642 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CntfP51642 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CntfP51642 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CntfP51642 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CntfP51642 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CntfP51642 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CntfP51642 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CntfP51642 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CntfP51642 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CntfP51642 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CntfP51642 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CntfP51642 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CntfP51642 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CntfP51642 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CntfP51642 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CntfP51642 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CntfP51642 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CntfP51642 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CntfP51642 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CntfP51642 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CntfP51642 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CntfP51642 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CntfP51642 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CntfP51642 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CntfP51642 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CntfP51642 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CntfP51642 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CntfP51642 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CntfP51642 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CntfP51642 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CntfP51642 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CntfP51642 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CntfP51642 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CntfP51642 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CntfP51642 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CntfP51642 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CntfP51642 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CntfP51642 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CntfP51642 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CntfP51642 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CntfP51642 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CntfP51642 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CntfP51642 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CntfP51642 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CntfP51642 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CntfP51642 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CntfP51642 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CntfP51642 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CntfP51642 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CntfP51642 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CntfP51642 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CntfP51642 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CntfP51642 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CntfP51642 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CntfP51642 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CntfP51642 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CntfP51642 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CntfP51642 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CntfP51642 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CntfP51642 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CntfP51642 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CntfP51642 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CntfP51642 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CntfP51642 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CntfP51642 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CntfP51642 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CntfP51642 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CntfP51642 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CntfP51642 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CntfP51642 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CntfP51642 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CntfP51642 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CntfP51642 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CntfP51642 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CntfP51642 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CntfP51642 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CntfP51642 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CntfP51642 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CntfP51642 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CntfP51642 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CntfP51642 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CntfP51642 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CntfP51642 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CntfP51642 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CntfP51642 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CntfP51642 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CntfP51642 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CntfP51642 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms