Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psen1P49769 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psen1P49769 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psen1P49769 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Psen1P49769 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psen1P49769 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Psen1P49769 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms