Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtpreP49446 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtpreP49446 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtpreP49446 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PtpreP49446 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PtpreP49446 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PtpreP49446 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PtpreP49446 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtpreP49446 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtpreP49446 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtpreP49446 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtpreP49446 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtpreP49446 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtpreP49446 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PtpreP49446 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtpreP49446 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtpreP49446 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PtpreP49446 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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