Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax7P47239 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax7P47239 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax7P47239 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax7P47239 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax7P47239 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax7P47239 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax7P47239 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pax7P47239 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax7P47239 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax7P47239 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax7P47239 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pax7P47239 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms