Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Usp4P35123 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp4P35123 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp4P35123 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Usp4P35123 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms