Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Apoc3P33622 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Apoc3P33622 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms