Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd10P28359 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd10P28359 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd10P28359 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Hoxd10P28359 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd10P28359 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd10P28359 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Hoxd10P28359 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Hoxd10P28359 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd10P28359 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Hoxd10P28359 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Hoxd10P28359 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Hoxd10P28359 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
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Hoxd10P28359 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Hoxd10P28359 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Hoxd10P28359 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Hoxd10P28359 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Hoxd10P28359 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd10P28359 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd10P28359 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Hoxd10P28359 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Hoxd10P28359 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd10P28359 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd10P28359 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Hoxd10P28359 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Hoxd10P28359 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Hoxd10P28359 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Hoxd10P28359 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms