Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CenpbP27790 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CenpbP27790 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CenpbP27790 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CenpbP27790 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CenpbP27790 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CenpbP27790 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CenpbP27790 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CenpbP27790 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms