Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2afxP27661 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2afxP27661 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2afxP27661 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
H2afxP27661 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2afxP27661 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2afxP27661 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2afxP27661 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2afxP27661 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2afxP27661 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2afxP27661 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2afxP27661 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2afxP27661 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2afxP27661 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2afxP27661 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms