Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ctnna1P26231 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ctnna1P26231 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms