Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gria1P23818 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gria1P23818 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gria1P23818 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gria1P23818 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gria1P23818 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gria1P23818 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gria1P23818 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms