Protein–RNA interactions for Protein: P21447

Abcb1a, Multidrug resistance protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1aP21447 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Abcb1aP21447 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Abcb1aP21447 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms