Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ntf3P20181 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ntf3P20181 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ntf3P20181 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ntf3P20181 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ntf3P20181 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ntf3P20181 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ntf3P20181 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ntf3P20181 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ntf3P20181 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ntf3P20181 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ntf3P20181 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ntf3P20181 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ntf3P20181 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ntf3P20181 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ntf3P20181 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ntf3P20181 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ntf3P20181 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ntf3P20181 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ntf3P20181 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ntf3P20181 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ntf3P20181 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ntf3P20181 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ntf3P20181 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ntf3P20181 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ntf3P20181 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ntf3P20181 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ntf3P20181 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ntf3P20181 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ntf3P20181 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ntf3P20181 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ntf3P20181 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ntf3P20181 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ntf3P20181 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ntf3P20181 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ntf3P20181 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ntf3P20181 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ntf3P20181 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ntf3P20181 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ntf3P20181 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ntf3P20181 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ntf3P20181 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ntf3P20181 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ntf3P20181 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ntf3P20181 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ntf3P20181 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ntf3P20181 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ntf3P20181 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ntf3P20181 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ntf3P20181 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ntf3P20181 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ntf3P20181 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ntf3P20181 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ntf3P20181 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms