Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trim30aP15533 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trim30aP15533 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms