Protein–RNA interactions for Protein: P10078

Zfp28, Zinc finger protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp28P10078 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp28P10078 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp28P10078 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms