Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Schip1P0DPB4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms