Protein–RNA interactions for Protein: P01633

Igk-V19-17, Ig kappa chain V19-17, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igk-V19-17P01633 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Igk-V19-17P01633 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igk-V19-17P01633 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igk-V19-17P01633 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igk-V19-17P01633 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igk-V19-17P01633 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igk-V19-17P01633 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igk-V19-17P01633 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igk-V19-17P01633 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igk-V19-17P01633 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igk-V19-17P01633 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igk-V19-17P01633 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igk-V19-17P01633 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igk-V19-17P01633 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Igk-V19-17P01633 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms