Protein–RNA interactions for Protein: O88735

Map7, Ensconsin, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map7O88735 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Map7O88735 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Map7O88735 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Map7O88735 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Map7O88735 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Map7O88735 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Map7O88735 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Map7O88735 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Map7O88735 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Map7O88735 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Map7O88735 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Map7O88735 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Map7O88735 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Map7O88735 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Map7O88735 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Map7O88735 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Map7O88735 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Map7O88735 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Map7O88735 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Map7O88735 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Map7O88735 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Map7O88735 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Map7O88735 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Map7O88735 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Map7O88735 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Map7O88735 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Map7O88735 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Map7O88735 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Map7O88735 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Map7O88735 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Map7O88735 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Map7O88735 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Map7O88735 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Map7O88735 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Map7O88735 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Map7O88735 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Map7O88735 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Map7O88735 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Map7O88735 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Map7O88735 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Map7O88735 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Map7O88735 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Map7O88735 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Map7O88735 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Map7O88735 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Map7O88735 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Map7O88735 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Map7O88735 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Map7O88735 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Map7O88735 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Map7O88735 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Map7O88735 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Map7O88735 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Map7O88735 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Map7O88735 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Map7O88735 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Map7O88735 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Map7O88735 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Map7O88735 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Map7O88735 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Map7O88735 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Map7O88735 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Map7O88735 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Map7O88735 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Map7O88735 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Map7O88735 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Map7O88735 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Map7O88735 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Map7O88735 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Map7O88735 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Map7O88735 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Map7O88735 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Map7O88735 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Map7O88735 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Map7O88735 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Map7O88735 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Map7O88735 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Map7O88735 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Map7O88735 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Map7O88735 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Map7O88735 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Map7O88735 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Map7O88735 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Map7O88735 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Map7O88735 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Map7O88735 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Map7O88735 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Map7O88735 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Map7O88735 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Map7O88735 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Map7O88735 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Map7O88735 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Map7O88735 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Map7O88735 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Map7O88735 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Map7O88735 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Map7O88735 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Map7O88735 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Map7O88735 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Map7O88735 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms