Protein–RNA interactions for Protein: O88543

Cops3, COP9 signalosome complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops3O88543 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cops3O88543 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cops3O88543 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops3O88543 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops3O88543 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops3O88543 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops3O88543 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops3O88543 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops3O88543 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops3O88543 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cops3O88543 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms