Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nid2O88322 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nid2O88322 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nid2O88322 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nid2O88322 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nid2O88322 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nid2O88322 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nid2O88322 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nid2O88322 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nid2O88322 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nid2O88322 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nid2O88322 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nid2O88322 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms