Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrxO55103 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PrxO55103 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrxO55103 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrxO55103 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrxO55103 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrxO55103 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrxO55103 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrxO55103 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrxO55103 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrxO55103 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrxO55103 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrxO55103 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrxO55103 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrxO55103 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrxO55103 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrxO55103 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrxO55103 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrxO55103 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrxO55103 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrxO55103 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrxO55103 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrxO55103 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrxO55103 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PrxO55103 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrxO55103 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrxO55103 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrxO55103 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrxO55103 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PrxO55103 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PrxO55103 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PrxO55103 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PrxO55103 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PrxO55103 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PrxO55103 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PrxO55103 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PrxO55103 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PrxO55103 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PrxO55103 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PrxO55103 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PrxO55103 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PrxO55103 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrxO55103 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PrxO55103 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrxO55103 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrxO55103 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrxO55103 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrxO55103 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrxO55103 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrxO55103 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PrxO55103 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrxO55103 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrxO55103 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrxO55103 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PrxO55103 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrxO55103 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrxO55103 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrxO55103 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrxO55103 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrxO55103 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrxO55103 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PrxO55103 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrxO55103 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrxO55103 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrxO55103 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrxO55103 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PrxO55103 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrxO55103 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrxO55103 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrxO55103 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrxO55103 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrxO55103 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrxO55103 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrxO55103 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrxO55103 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrxO55103 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrxO55103 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrxO55103 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PrxO55103 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrxO55103 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrxO55103 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrxO55103 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrxO55103 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrxO55103 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrxO55103 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrxO55103 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrxO55103 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrxO55103 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrxO55103 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrxO55103 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrxO55103 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrxO55103 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrxO55103 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrxO55103 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrxO55103 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrxO55103 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrxO55103 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrxO55103 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PrxO55103 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PrxO55103 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms