Protein–RNA interactions for Protein: O35111

Kcnk3, Potassium channel subfamily K member 3, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk3O35111 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnk3O35111 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kcnk3O35111 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnk3O35111 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnk3O35111 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnk3O35111 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnk3O35111 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnk3O35111 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnk3O35111 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnk3O35111 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnk3O35111 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnk3O35111 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kcnk3O35111 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Kcnk3O35111 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Kcnk3O35111 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Kcnk3O35111 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Kcnk3O35111 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Kcnk3O35111 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms