Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CckarO08786 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CckarO08786 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CckarO08786 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CckarO08786 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CckarO08786 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CckarO08786 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CckarO08786 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CckarO08786 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CckarO08786 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CckarO08786 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CckarO08786 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CckarO08786 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CckarO08786 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CckarO08786 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CckarO08786 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CckarO08786 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CckarO08786 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CckarO08786 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CckarO08786 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CckarO08786 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CckarO08786 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CckarO08786 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CckarO08786 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CckarO08786 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CckarO08786 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CckarO08786 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CckarO08786 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CckarO08786 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CckarO08786 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CckarO08786 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CckarO08786 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CckarO08786 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CckarO08786 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CckarO08786 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CckarO08786 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CckarO08786 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CckarO08786 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CckarO08786 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CckarO08786 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CckarO08786 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CckarO08786 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CckarO08786 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CckarO08786 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CckarO08786 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CckarO08786 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CckarO08786 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CckarO08786 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CckarO08786 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CckarO08786 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CckarO08786 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CckarO08786 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CckarO08786 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CckarO08786 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CckarO08786 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CckarO08786 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CckarO08786 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CckarO08786 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CckarO08786 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CckarO08786 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CckarO08786 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CckarO08786 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CckarO08786 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CckarO08786 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CckarO08786 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CckarO08786 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CckarO08786 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CckarO08786 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CckarO08786 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CckarO08786 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CckarO08786 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CckarO08786 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CckarO08786 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CckarO08786 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CckarO08786 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CckarO08786 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CckarO08786 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CckarO08786 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CckarO08786 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CckarO08786 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CckarO08786 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CckarO08786 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CckarO08786 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CckarO08786 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CckarO08786 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CckarO08786 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CckarO08786 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CckarO08786 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CckarO08786 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CckarO08786 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CckarO08786 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CckarO08786 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CckarO08786 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CckarO08786 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CckarO08786 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CckarO08786 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CckarO08786 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CckarO08786 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CckarO08786 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CckarO08786 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms