Protein–RNA interactions for Protein: L7N1Z3

Vmn1r80, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r80L7N1Z3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms