Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm20834J3QM72 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20834J3QM72 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm20834J3QM72 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms