Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r34G3XA52 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r34G3XA52 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r34G3XA52 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r34G3XA52 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r34G3XA52 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r34G3XA52 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r34G3XA52 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r34G3XA52 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r34G3XA52 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r34G3XA52 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r34G3XA52 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r34G3XA52 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r34G3XA52 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r34G3XA52 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r34G3XA52 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r34G3XA52 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r34G3XA52 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r34G3XA52 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r34G3XA52 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r34G3XA52 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r34G3XA52 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r34G3XA52 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r34G3XA52 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r34G3XA52 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r34G3XA52 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r34G3XA52 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r34G3XA52 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r34G3XA52 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r34G3XA52 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r34G3XA52 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r34G3XA52 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r34G3XA52 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r34G3XA52 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r34G3XA52 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r34G3XA52 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r34G3XA52 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r34G3XA52 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms