Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms