Protein–RNA interactions for Protein: G3UXD1

Speer4c, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4cG3UXD1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Speer4cG3UXD1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Speer4cG3UXD1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms