Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp9yF8VPU6 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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