Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Farp1F8VPU2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms