Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

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Length 2,391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC067074F6RXI4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC067074F6RXI4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
BC067074F6RXI4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC067074F6RXI4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC067074F6RXI4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC067074F6RXI4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC067074F6RXI4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
BC067074F6RXI4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC067074F6RXI4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC067074F6RXI4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC067074F6RXI4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC067074F6RXI4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC067074F6RXI4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC067074F6RXI4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC067074F6RXI4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC067074F6RXI4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC067074F6RXI4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC067074F6RXI4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC067074F6RXI4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC067074F6RXI4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC067074F6RXI4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
BC067074F6RXI4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC067074F6RXI4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC067074F6RXI4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC067074F6RXI4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
BC067074F6RXI4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC067074F6RXI4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC067074F6RXI4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC067074F6RXI4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC067074F6RXI4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC067074F6RXI4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC067074F6RXI4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC067074F6RXI4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC067074F6RXI4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC067074F6RXI4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC067074F6RXI4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC067074F6RXI4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC067074F6RXI4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC067074F6RXI4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
BC067074F6RXI4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
BC067074F6RXI4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC067074F6RXI4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BC067074F6RXI4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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