Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc7bE9Q9Y3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms