Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Zfp558E9Q1J0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Zfp558E9Q1J0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Zfp558E9Q1J0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Zfp558E9Q1J0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Zfp558E9Q1J0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Zfp558E9Q1J0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Zfp558E9Q1J0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Zfp558E9Q1J0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Zfp558E9Q1J0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Zfp558E9Q1J0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Zfp558E9Q1J0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Zfp558E9Q1J0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Zfp558E9Q1J0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Zfp558E9Q1J0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Zfp558E9Q1J0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Zfp558E9Q1J0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp558E9Q1J0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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