Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2610021A01RikE9Q0Q3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms