Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cdr1E9Q0B4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms