Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms