Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm20547B8JJN0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20547B8JJN0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20547B8JJN0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20547B8JJN0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20547B8JJN0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20547B8JJN0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20547B8JJN0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20547B8JJN0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20547B8JJN0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20547B8JJN0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20547B8JJN0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20547B8JJN0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20547B8JJN0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20547B8JJN0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20547B8JJN0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20547B8JJN0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20547B8JJN0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20547B8JJN0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20547B8JJN0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20547B8JJN0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20547B8JJN0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20547B8JJN0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm20547B8JJN0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20547B8JJN0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20547B8JJN0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20547B8JJN0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20547B8JJN0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20547B8JJN0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20547B8JJN0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20547B8JJN0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20547B8JJN0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20547B8JJN0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20547B8JJN0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20547B8JJN0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20547B8JJN0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20547B8JJN0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20547B8JJN0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20547B8JJN0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20547B8JJN0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm20547B8JJN0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms