Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Phf11cB4XVP9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Phf11cB4XVP9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms