Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm2012B1B0R1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 425.7 ms