Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssxb8B1AY40 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssxb8B1AY40 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssxb8B1AY40 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssxb8B1AY40 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssxb8B1AY40 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssxb8B1AY40 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssxb8B1AY40 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssxb8B1AY40 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssxb8B1AY40 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssxb8B1AY40 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssxb8B1AY40 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssxb8B1AY40 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssxb8B1AY40 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssxb8B1AY40 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssxb8B1AY40 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssxb8B1AY40 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssxb8B1AY40 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssxb8B1AY40 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssxb8B1AY40 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssxb8B1AY40 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssxb8B1AY40 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssxb8B1AY40 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssxb8B1AY40 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssxb8B1AY40 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssxb8B1AY40 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssxb8B1AY40 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssxb8B1AY40 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssxb8B1AY40 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssxb8B1AY40 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssxb8B1AY40 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssxb8B1AY40 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssxb8B1AY40 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssxb8B1AY40 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssxb8B1AY40 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssxb8B1AY40 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssxb8B1AY40 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssxb8B1AY40 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssxb8B1AY40 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssxb8B1AY40 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssxb8B1AY40 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssxb8B1AY40 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssxb8B1AY40 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ssxb8B1AY40 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ssxb8B1AY40 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ssxb8B1AY40 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ssxb8B1AY40 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ssxb8B1AY40 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ssxb8B1AY40 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ssxb8B1AY40 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ssxb8B1AY40 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ssxb8B1AY40 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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