Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
H2al1jA2BFR3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
H2al1jA2BFR3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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