Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdl2A2AGA4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdl2A2AGA4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdl2A2AGA4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdl2A2AGA4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdl2A2AGA4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdl2A2AGA4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdl2A2AGA4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdl2A2AGA4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdl2A2AGA4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdl2A2AGA4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdl2A2AGA4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdl2A2AGA4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdl2A2AGA4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdl2A2AGA4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdl2A2AGA4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdl2A2AGA4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdl2A2AGA4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdl2A2AGA4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rhbdl2A2AGA4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdl2A2AGA4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdl2A2AGA4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdl2A2AGA4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdl2A2AGA4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdl2A2AGA4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdl2A2AGA4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdl2A2AGA4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdl2A2AGA4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdl2A2AGA4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdl2A2AGA4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdl2A2AGA4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdl2A2AGA4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdl2A2AGA4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdl2A2AGA4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdl2A2AGA4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdl2A2AGA4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdl2A2AGA4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdl2A2AGA4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rhbdl2A2AGA4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhbdl2A2AGA4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhbdl2A2AGA4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhbdl2A2AGA4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhbdl2A2AGA4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhbdl2A2AGA4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhbdl2A2AGA4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhbdl2A2AGA4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhbdl2A2AGA4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhbdl2A2AGA4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhbdl2A2AGA4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhbdl2A2AGA4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhbdl2A2AGA4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rhbdl2A2AGA4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhbdl2A2AGA4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhbdl2A2AGA4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhbdl2A2AGA4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhbdl2A2AGA4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhbdl2A2AGA4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhbdl2A2AGA4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhbdl2A2AGA4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhbdl2A2AGA4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhbdl2A2AGA4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rhbdl2A2AGA4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl2A2AGA4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl2A2AGA4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl2A2AGA4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl2A2AGA4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl2A2AGA4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl2A2AGA4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl2A2AGA4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl2A2AGA4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl2A2AGA4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl2A2AGA4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl2A2AGA4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl2A2AGA4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl2A2AGA4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl2A2AGA4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl2A2AGA4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl2A2AGA4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl2A2AGA4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl2A2AGA4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl2A2AGA4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl2A2AGA4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl2A2AGA4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl2A2AGA4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl2A2AGA4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl2A2AGA4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl2A2AGA4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl2A2AGA4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl2A2AGA4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl2A2AGA4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rhbdl2A2AGA4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdl2A2AGA4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdl2A2AGA4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdl2A2AGA4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdl2A2AGA4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdl2A2AGA4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdl2A2AGA4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdl2A2AGA4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdl2A2AGA4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rhbdl2A2AGA4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms