Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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