Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G9

Trbv5, T cell receptor beta, variable 5 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv5A0A0B4J1G9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
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Trbv5A0A0B4J1G9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trbv5A0A0B4J1G9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trbv5A0A0B4J1G9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trbv5A0A0B4J1G9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv5A0A0B4J1G9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv5A0A0B4J1G9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Trbv5A0A0B4J1G9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Trbv5A0A0B4J1G9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Trbv5A0A0B4J1G9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv5A0A0B4J1G9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Trbv5A0A0B4J1G9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Trbv5A0A0B4J1G9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Trbv5A0A0B4J1G9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Trbv5A0A0B4J1G9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Trbv5A0A0B4J1G9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Trbv5A0A0B4J1G9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv5A0A0B4J1G9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv5A0A0B4J1G9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv5A0A0B4J1G9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv5A0A0B4J1G9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv5A0A0B4J1G9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv5A0A0B4J1G9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv5A0A0B4J1G9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv5A0A0B4J1G9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv5A0A0B4J1G9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv5A0A0B4J1G9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv5A0A0B4J1G9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trbv5A0A0B4J1G9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv5A0A0B4J1G9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv5A0A0B4J1G9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv5A0A0B4J1G9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv5A0A0B4J1G9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv5A0A0B4J1G9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv5A0A0B4J1G9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trbv5A0A0B4J1G9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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