Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWX0

Ighv1-19, Immunoglobulin heavy variable V1-19 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ighv1-19A0A0A6YWX0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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