Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 AC009500.1-201ENST00000420684 583 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 AC069277.1-205ENST00000432743 630 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 RN7SL502P-201ENST00000481857 290 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 AC113191.1-201ENST00000517759 403 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 AZIN1-AS1-211ENST00000520455 480 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 AL133297.1-201ENST00000568149 404 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 AL121936.2-201ENST00000641935 662 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 ZC3H11A-204ENST00000367214 3451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 CD209-203ENST00000315599 4283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 AC007406.5-201ENST00000570140 3170 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 MRO-201ENST00000256425 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 RNF146-215ENST00000616343 2077 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 ZNF260-202ENST00000523638 5666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD44-202ENST00000328737 3686 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 OR52N5-201ENST00000317093 1034 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 LINC00575-201ENST00000426551 910 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 AC073476.1-201ENST00000452854 407 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 LINC02237-201ENST00000521753 805 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 MAGOHB-204ENST00000539554 666 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 RPL41P2-201ENST00000544920 409 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 AC010809.1-201ENST00000560268 562 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 AC097467.3-216ENST00000599555 1293 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 AL589740.1-209ENST00000607032 1056 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 TRIM49D1-203ENST00000605881 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 NBPF14-209ENST00000620240 2656 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 DAZ2-202ENST00000382306 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 KCNMB2-204ENST00000432997 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 DYNC2LI1-210ENST00000605786 1346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 LRTOMT-210ENST00000447974 2007 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 TCF4-225ENST00000564999 3590 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 ZNF718-201ENST00000510175 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 DACH2-207ENST00000510272 1764 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 ADGRL3-205ENST00000506746 4935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 AC007620.2-201ENST00000600539 1697 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 C2CD6-201ENST00000286195 2104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 RNA5SP188-201ENST00000362916 129 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 FPGT-TNNI3K-201ENST00000370893 1195 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 AC114498.1-201ENST00000423796 607 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 MED28P4-201ENST00000433137 572 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 LRRC23-208ENST00000436789 796 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
APOBEC3GQ9HC16 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.6 ms